Главная страница
qrcode

Как рисовать картинки так, чтобы их понимали


Скачать 14.01 Mb.
НазваниеКак рисовать картинки так, чтобы их понимали
Анкор[2014]SchoolFigures.pdf
Дата28.11.2017
Размер14.01 Mb.
Формат файлаpdf
Имя файла2014_SchoolFigures.pdf
оригинальный pdf просмотр
ТипДокументы
#49402
Каталогid134157263

С этим файлом связано 13 файл(ов). Среди них: AIR_13-2_LoRes-40dpi.pdf, Сорок первый.docx, Филатов Леонид. Про Федота-стрельца, удалого мо...doc, Use_R_33_Hadley_Wickham-ggplot2_elegant_g_-_Niei.pdf, Узбекский Дед Мороз.docx, Чума на оба ваши дома.docx, Энеида.docx, R_Graphics_Cookbook_-_Winston_Chang.pdf, Новостная заметка.doc и ещё 3 файл(а).
Показать все связанные файлы

Как рисовать картинки
так, чтобы их понимали?

Кто читает ваши статьи?
В теории...
На практике!

Кто читает ваши статьи?
В теории...
На практике!

Модели читателя
Модель 1: профессор на рейсе Токио--Нью-Йорк который был задержан на 12 часов.
Модель 2: студент в 3 часа утра, которому нужно рассказать Вашу статью завтра
Модель 3: занятой профессор, у которого есть 5 минут чтобы проглядеть вашу статью, и (не) дать ее своим студентам на разбор
Модель 4: Вы, когда Вы читаете чужие статьи!

Как люди читают ваши статьи?
500 человек
Абстракт
250 человек
Картинка №1 100 человек
Все картинки
30 человек
Результаты и заключение
10 человек
Всю статью
5 человек
Сапплемент
Можно ли это изменить?

Можно!
500 человек
Абстракт
250 человек
Картинка №1 100 человек
Все картинки
30 человек
Результаты и заключение
10 человек
Всю статью
5 человек
Сапплемент
Но для этого нужно рисовать хорошие картинки
220 200 100 50

Почему это сложно?
Проблема рефлексии: увидеть свои картинки глазами человека, который видит их впервые
Разные читатели: сделать понятно для новичков и интересно для экспертов
Логическая последовательность: если читатель может что-то перепутать или не понять, он сделает это!

- Данные на картинке: не все графики одинаково полезны
- Один график: оси, легенда, подписи
- Много графиков: расположение, цветовая схема, похожесть и контраст
- Цвет: чему можно научиться у дизайнеров?
- Организация труда: как сохранить время!
- Дальше: как и у кого учиться?
Схема сегодняшней презентации

Минимализм
Если что-то есть на картинке, это должно быть правда нужно
Полнота
Если картинка не понятна, сделайте ее понятной, добавив недостающие элементы
Согласованность
Элементы связанные визуально должны быть связаны логически, и наоборот
Краткое содержание в 4 словах
Последовательность
Одна картинка рассказывает одну историю; разные части картинки раскрывают ее последовательно.

Графики: до и после
Microsoft Excel
-Рамочка вокруг графика
-Рамочка вокруг легенды
-Тяжелый фон
-Толстые тяжелые линии сетки
-”Пикселированные” линии
-Уродливые шрифты
-Цифры оси Х не совпадают с делениями
Пакет “seaborn” (Python)
аналог – ggplot2 (язык R)
+Более приятные цвета
+Линии сетки не мешают глазу
+Красиво показаны ошибки
+Красивые шрифты
+Хорошее использование прозрачностей

Scatterplot: сильное оружие!
Простой график
Хорошо оформленный

Scatterplot. Сколько здесь измерений?

Чтобы избежать перекрытия точек…
Можно сделать их меньше
Или сделать прозрачными

Не забывайте про порядок точек
Данные слева и справа одни и те же. Точки справа переставлены в случайном порядке.
Помните про это при чтении статей!

Визуализация распределений
Для жизни…
Для пафосных картинок

Спорные визуализации распределений
Гистограммы с прозрачностью выглядят плохо
Боксплоты не особо информативны
Другие неидеальные разновидности гистограмм

Violin plot – выглядит круто, и
весьма информативен

Кресты ошибок: как и зачем?
Измерение 1 Измерение 2
Среднекв. отклонение
Ошибка среднего
90% Доверительный интервал

Столбики, пироги и прочая ерунда
Science
Cell (full-page figure!)
Nature
Каждый из этих графиков содержит 2-4 числа, которые можно было бы написать текстом (или в легенде), или оформить как вставку.

Чистые или обработанные данные?
Чистые данные
Обработанные данные
Чистые данные - можно проследить конкретные точки
Обработанные данные - показывают результаты анализа

Чистые данные?
Чистые данные должны быть графически представлены в статье, желательно в тексте, обязательно - в сапплементе
Желательно, чтобы все выводы сделанные в статье были видны в чистых, либо в минимально обработанных данных (т.е. если можно заменить гистограммку или pie-chart на какой-нибудь график или scatterplot - это нужно сделать). Скептически- настроенный читатель или рецензент захочет увидеть весь путь, по которому выводы получаются из данных.
Разные реализации важны (например, картинки разных клеток с микроскопа): покажите несколько в тексте и много в сапплементе. Читатель заметит, что вы не выбрали одну красивую картинку.
Если в данных меньше тысячи точек - покажите большую картинку в сапплементе, где можно проследить все точки

Часть 2: оформление графика
Убираем все лишнее
Делаем график логичнее
Добавляем красивостей

Рамочки ставят преграду для глаза
Рамочки делают картинки менее понятными; это особенно плохо если картинка очень маленькая
Отсутствие рамочек позволяют пододвинуть легенду чуть подальше от центра картинки, и сохранить просвет между легендой и графиком.
(про следующий слайд) сравните легенду слева и справа
График без рамочки

(Бонус) Акцент правого графика на метафазе выделен более сочными цветами, и порядком линий
Добавляем креатива в легенду
Линии легенды в том же порядке, что линии на графике
Объединение линий
Пишем текст цветом

Линии сетки создают много визуальных помех, что особенно заметно на тесных графиках (пример вверху справа).
Используйте линии сетки, только если вы хотите, чтобы читатель мог проследить численные значения точек на графике.
Возможный компромисс: “отрицательные” линии сетки, т.е. белые линии, вырезанные из графика или фона

Делайте подписи словами!
А лучше - картинками! :)
Если Вам необходимо указать название переменной, пишите как
“Длина тела шушпанчика, L (см)”

Пользуйтесь вставками, чтобы
улучшить понимание

Диапазон осей
Разный диапазон по оси
У может создать видимость что метод 2 лучше чем метод 1
Натуральный диапазон по оси У показывает, что метод 1 лучше метода 2
Это пространство можно заполнить легендой, иллюстрацией или вставкой

Текст и подписи
Подписи к картинкам должны объяснять все, что нарисовано на картинке, и откуда это взялось!
Рис. 1 показывает среднюю длину тела шушпанчика в зависимости от возраста для разных показателей лохматости.
Кресты ошибок показывают (стандартную ошибку /
стандартную ошибку среднего / 95% доверительный
интервал). Лохматость (шкала им Сусликова) измерялась
тремя независимыми экспертами.
Рис. 2 Кривые роста для 6 лохматых шушпанчиков
сравниваются с моделью роста шуршунчика (L=A*log(T
+Kh)) (см. [11]) для показателей лохматости Kh=1, 5, 10.
Для каждого показателя лохматости, подгоночный параметр A был подобран чтобы минимизировать разницу между модельюи средней кривой роста.
NB: в постере выделение можно сохранить для облегчения понимания

Подписи для постеров должны быть
короче и допускают вольность
«Рост лысых и лохматых шушпанчиков от времени»
Можно делать подписи под каждой панелью картинки
Длина измерялась от начала хвоста до кончика носа
Вес измерялся до завтрака
Номер картинки («Рис 1») нужен только если есть перекрестные ссылки между разными панелями.

Разные линии: что с ними делать?
4 измерения: цвет, пунктир/сплошная/точечками, без маркеров/крестики/точечки, толщина
Для себя: делайте все, что угодно (см выше).
Проблема: если Вы за неделю привыкли к вашему способу представления данных, не требуйте чтобы другие понимали это за 5 минут.

Картинки: для себя, для доклада,
для статьи
• Для себя: разобраться в данных
• Для друзей: показать результаты быстро и понятно
• Для статьи: показать главное, остаться в рамках

Картинки для себя
• Задача: понять данные
• Используйте средства по максимуму
• Картинки на полный экран
• Разный масштаб, интерактивность
• Совмещайте разные типы графиков для одних и тех же данных
• Время и место не ограничены

Картинки для коллег (семинары,
доклады, email, постеры)
• Задача: сделать картинку понятной
• Место не ограничено, время ограничено!
• Свобода оформления (цвет, подписи)
• Важно: вы смотрели на картинки неделю, у человека есть минута

Картинки для статьи
• Очень мало места
• Оставьте только главное!
• Строгость оформления, много ограничений
• Должны читаться при черно-белой печати

Разные цветовые схемы
Цвет – последовательно меняющаяся величина
Каждый цвет независимый
Цветовой тон – тип клеток
Насыщенность – фаза клеточного цикла

Последовательная цветовая схема, которую
можно печатать на черно-белом принтере
Nature Methods: “Point of view”

Инструменты для цветовых схем
1. Color Brewer
2. ColorSchemeDesigner
3. I want hue
4. Photoshop/Illustrator color guide
5. ekuler.adobe.com

Часть два: много графиков
Одинаковое должно быть одинаковым.
Совсем одинаковым.
Разное должно быть разным. Очень разным.

Идентичные графики
-Абсолютно одинаковый размер, идентичные оси
-Абсолютное выравнивание по вертикали и горизонтали
-По возможности: одинаковое расположение легенды
-Подписи в последующих графиках лучше опустить

Графики с общей осью
Общая ось всегда должна быть выравнена сама с собой!

Можно подписывать только одну
ось

Альтернативные варианты
Две оси: справа и слева
Общая ось с относительными единицами

Графики выравниваются по оси
(а не по подписи)
Графики с картинками выравниваются по оси
Буковки a,b,c,d в панелях выравниваются друг с другом
Выравнивание может создавать пустое пространство. Это ОК.

Толщина линий и размер шрифта
должны быть строго одинаковыми
Поэтому нужно пользоваться вектором

В растре увеличение и уменьшение графиков меняет толщину линий

Два способа изменения размера в векторе
с сохранением
толщины
Без сохранения
толщины
Illustrator: Edit à
Preferences à General à
Scale strokes and effects
Пользуйтесь сохранением толщины при масштабировании частей сложных иллюстраций

Цвета должны быть последовательны
Это требует планирования, если разные части картинки созданы в разных программах.
Договоритесь о цветовой схеме заранее, особенно при работе в команде; назначьте каждому объекту главный и дополнительные цвета.
В векторе их можно поменять при составлении картинки, но растровые изображения нужно будет переделывать.
Если в статье есть два или три ключевых объекта, дайте им свои цвета (здесь синий и грязно-желтый)

Избегайте случайных совпадений
цветов
Между графиками, а также между графиками и изображениями (в т.ч. heatmaps)
Эти синие штуки не связаны между собой, но читатель может перепутать.

Контраста не должно быть много!
Красный-синий-зеленый дает много контраста.
После такого графика Вы не сможете больше использовать почти никакие цвета.
Случайно выбранная палитра из светлых ненасыщенных цветов.
Все цвета слева еще можно использовать.
(с помощью IWantHue)

Цветовая схема для heat maps
“jet”
Реальные данные
Наша любимая цветовая схема

Организация труда: как не запариться
Программа построения графиков делает большую часть работы.
Все «украшения» добавляются перед подачей в журнал

Что нужно делать программно?
• Выставить размер картинки
• Менять цвета, толщину линий
• Убирать рамочки
• Менять шрифты
• Выставлять диапазон осей
• Выставлять деления
• Управлять легендой

Про размер картинок
Размер важен, т.к. толщина линии фиксирована
• Линии и оси – минимум 1 pt
• Вспомогательные линии – до 0.5 pt
• Шрифты – 6pt или больше
Для проверки распечатайте графики в реальном размере, вырежьте и приложите к свежему выпуску Nature/Science/Cell.

Чем рисовать
• R – гибкий, почти интерактивный(R studio), красивый
• Matplotlib (+seaborn) (Python) & сложнее в освоении, интерактивные, красивые
• Matlab – интерактивный, хорошая справка
• Origin, Prizm, SigmaPlot – не требуют программирования
В нашей лабе все пользуются разными инструментами (Matlab, Matplotlib, R,
Mathematica).

Я не хочу все переделывать!
• В векторе можно многое исправить
• Поменять цвета и толщину
• Поменять размер
• Поменять диапазон осей
• Сжать и растянуть (сложнее)
• Подвинуть точки и линии
• Поменять шрифты

Ресурсы
Non-designer’s design book
Nature Methods “Point of view”
Vizbi.org (“visualizing for biology” conference)
Elegant graphics for data analysis (R)
R graphics cookbook
Наш любимец - Edward Tufte, хоть и пишет он не очень связно

Время + фидбэк = хорошие картинки

перейти в каталог файлов


связь с админом